1998年，7项成果获江苏省第五次哲学社会科学优秀成果评奖三等奖。
1999年5-8月，开展第三次哲学社会科学优秀成果评奖活动。接受申报成果216项，评出55项获奖成果。其中5项一等奖，10项二等奖，40项三等奖。参加江苏省第六次优秀成果评奖，获得三等奖5项，二等奖1项。
1999年11月12日，由市国资局、社科联召开“城镇集体资产管理与改革专题研讨会”，收到论文20篇。评选出6篇获奖论文在会上交流。会议邀请国家财政部统计评估司副司长、清核办副主任朱恩泽教授作专题报告。
1999年12月20日，市委宣传部、研究室、市司法局、依法治市领导小组办公室、社科联共同主办依法治市理论与实践研讨会。共收到研讨论文70多篇。会上评选出24篇获奖论文。市委书记方之焯到会讲话。
2000年3月，召开四届五次理事会，唐明觉当选为副主席（专职）。
2000年11月19日，镇江、扬州两市社科联、交通运输协会和江苏理工大学、扬州大学等共同发起主办第二次“以大桥建设为契机，加快两市发展理论研讨会”。研讨会在镇江、扬州两地召开。收到论文40篇，着重研讨如何利用大桥加快发展两市交通、旅游、港口和经贸事业，改善城市布局，互补两地经济等课题。会议期间，组织与会代表参观两市桥址。省社科联副主席廖进、市委副书记陈文湘出席并讲话。
2001年5-8月，开展第四次哲学社会科学优秀成果评奖，本次评奖增加“决策咨询奖”。共收到申报成果120项，评出一等奖5项，二等奖10项，三等奖40项，决策咨询奖6项。
2002-2006年
2002年2月起，根据江苏省新闻出版局和省社科联文件精神，《镇江学刊》改为《镇江社会科学》，大16开本，双月刊。
2002年6月22日上午，社科联、京口区委宣传部在大市口广场举办主题为“实践‘三个代表’社会科学在我身边”大型咨询普及活动，即第一届社科普及周。
2002年11月，经市委批准，市社科联建立了党组，陈伟任党组书记。
2003年1月3日，社科联召开第五次代表大会，陈伟当选为社科联主席，严忠沛（专职）、唐明觉（专职）、唐永泽、孙秀发、唐成海、姜辉、顾大福、尹卫东当选为副主席。大会对社科联章程进行修改，社科联届期由4年改为5年，将“镇江市哲学社会科学联合会”名称更改为“镇江市哲学社会科学界联合会”；对市第四次社科成果奖和2001-2002年先进学会、先进学会工作者进行表彰。
2003年1月，市委宣传部、市社科联在市委宣传部会议室召开“学习十六大精神座谈会”，联系镇江实际学习领会十六大精神和实质。全市各级宣传工作者、各学会秘书长40人参加。
2003年3月，市纪委、市社科联、市纪检监察学会在市纪委会议室召开“党风廉政建设反腐败工作源头治理积极预防专题研讨会”，约120人参加。
2003年7-10月，开展市第五次哲学社会科学优秀成果评奖活动，共接受申报145项，共评出一等奖3项，二等奖10项，三等奖48项。
2004年5月，市社科联集中力量开展以“社会科学在我身边”为主题的“六个一”系列普及活动，即第二届社科普及周。主要活动由：一场广场咨询，近30个学会、协会（研究会）的社科工作者100多人接受广大市民的咨询；一次座谈会，邀请学会秘书长畅谈学习中央3号文件的体会；一个专版：在《镇江日报》开辟一个学习专版；一个社科书市，邀请市新华书店在市民广场开办社科书市；一场报告会，邀请省委宣传部副部长周易之为镇江市200多名社科工作者解读中央3号文件；一个培训班，组织为期5天的学会秘书长及学会骨干培训班，请市委党校资深专家讲授科学发展观和“三个代表”重要思想，交流学会工作。市委副书记吴树南到现场看望参加咨询活动和社科工作者。本次“六个一”系列活动获省社科联优秀组织奖。
2004年8月，市委宣传部、市委党校、市社科联在市委党校会议室召开“纪念邓小平诞辰100周年理论研讨会”，约150人参加。
2004年9月，市社科联在镇江宾馆承办省社科联举办的海峡两岸中华文化发展论坛，12名台湾学者及新闻、文化工作者与镇江市学者共同探讨、交流中华文化。市领导许津荣、吴树南、张甫雄、王萍等会见台湾客人，台湾客人参观了定慧寺和金山寺。
2005年1月4日，市委召开了全市哲学社会科学工作会议，贯彻2004年中央3号文件、省委13号文件以及全省哲学社会科学工作大会精神。会议由市委常委、宣传部长张甫雄主持，市委副书记吴树南代表市委讲话，市人大、市政协领导出席了会议，会议表彰了2003-2004年度先进学会和学会先进工作者。
2005年4月，镇江、扬州两市社科联联合在扬州召开“润扬大桥与区域经济发展”理论研讨会。共征集到52篇高质量的论文，两市专家学者、实际工作者分别从大桥开通后对区域经济的合作、互补竞争的影响，文化、旅游的交流等方面开展研讨，为两市的经济社会发展献计献策。
2005年5-8月，开展第六次哲学社会科学优秀成果评奖活动，共收到申报成果211项，评出优秀成果61项，其中包括一等奖4项、二等奖10项、三等奖46项。
2005年8月，市委宣传部、市社科联在市宣传部会议室召开“纪念抗日战争胜利60周年学术讨论会”，研讨抗战胜利的重大意义及全民族团结抗战精神对今天的改革开放的指导意义。约50人参加。
2006年6月，市委宣传部副部长许星任市社科联党组书记。
2006年6月28日，市委常委、宣传部长张甫雄到市社科联现场办公，提出“三提高一加强”的工作要求，即提高服务中心服务发展的水平，提高开展重大学术交流活动的水平，提高社科知识普及宣传工作的水平，加强社科联自身建设。
2006年8月23日，扬中市社科联成立。省社科联党组书记孙燕丽，市委常委、宣传部长张甫雄参加成立仪式。
2006年8月30日，市社科联召开全市社科界学习《江泽民文选》座谈会。
2006年9月11日，市社科联和《镇江日报》社联合在《镇江日报》开设《社科了望》专栏。
2006年9月14日，中共镇江市委、市政府下发《关于进一步加强和改进社科联工作的意见》（镇发〈2006〉67号）。
2006年9月17日，市社科联在大市口广场举办第三届科普知识宣传周启动仪式。市委书记史和平发来贺信；市委副书记、市长许津荣也发来寄语，省社科联党组书记孙燕丽，市委常委、宣传部长张甫雄,副市长王萍，市人大秘书长蔡文俊，市政协秘书长陈惠祥，以及市总工会、团市委、妇联以及丹徒、京口、润州区委宣传部，镇江新区组织人事部的有关负责同志出席。
2006年9月19日，市社科联召开五届五次理事（扩大）会，选举市委宣传部副部长、市社科联党组书记许星为市社科联主席。同时，增补24名理事。市委常委、宣传部长张甫雄出席并讲话。
2007年
2007年5-7月，开展市第七次社会科学优秀成果评奖活动。共收到申报成果258项，评选出优秀成果72项，其中特别奖2项、一等奖5项、二等奖15项、三等奖50项。11月上旬，市委、市政府召开会议，对获奖成果进行了表彰奖励。推荐参加省社科成果评奖活动，共有10项成果获省三等奖。
2007年6月，宁镇扬三市社科联在南京共同举办“构建宁镇扬板块与区域共同发展”高层论坛，通过研讨为宁镇扬区域协调发展提供理论支持，为党委和政府的决策贡献对策建议。论坛邀请了中国社会科学院、华师大、省社科院等多位知名专家，征集到论文50多篇，三市分管副市长到会并发言，编印出版了论文集，并将论文集送有关领导、综合部门、研究部门。
2007年9月，以“繁荣社会科学喜迎党的盛会”为主题，举办第四届社会科学普及周。市委常委、宣传部长张甫雄以及市人大、市政府、市政协的领导参加宣传周的启动仪式
2007年11月9日镇江市社科联召开五届六次理事（扩大）会议暨第七届社科优秀成果颁奖大会。参加会议的领导有：市委常委、宣传部长张甫雄、副市长王萍、市委组织部副部长陈晨、市政府副秘书长朱金生、市委宣传部部务委员杨苏镇。经市委提名、五届六次理事会选举通过，潘文瑜同志当选为社科联主席，邵利明同志增补为专职副主席，市委党校党委书记、副校长王华、市政府研究室副主任张卫平增补为兼职副主席。市委常委、宣传部长张甫雄出席理事会，代表市委对新选举出的社科联主席、副主席表示热烈的祝贺，并要求社科联、社科界深入学习贯彻十七大精神，着力推进理论创新；充分利用整合优势资源，全面提升服务水平；切实加强自身建设，不断增强内在活力，实现全市哲学社会科学更好更快发展。
2007年11月，由省社科联主办、江苏大学承办、镇江市社科联协办的江苏省哲学社会科学界学术大会青年学者专场在江苏大学举行。大会征集论文300多篇，全省20多所高校的近百名青年学者齐聚江苏大学，就科学发展、人文精神、社会责任展开讨论和交流，进行主题发言。副市长王萍出席开幕式并讲话，《新华日报》、江苏电视台、江苏教育台及市新闻媒体对这一活动作了详细报道。
2007年11月，市委宣传部、社科联联合举行“全市十七大精神研讨会”。邀请高校、社科类学会、党校、市级机关、辖市区代表40人参加，发言交流论文10篇。
2007年，市社科联首次对全市社科类学会、协会、研究会会刊进行评选，评选出《党建之窗》、《镇江工商》、《保险信息导刊》等十家优秀会刊。
2008年
2008年，市社科联组织开展关于镇江文化产业大发展大繁荣的课题研究，完成了《关于镇江市市区三年（2008-2010年）文化产业重点项目的试试意见》，其主要精神被形成市委文件。市社科联以此编印了四期《社联策论》供领导参阅。
2008年9月，以“传播和谐文化、促进科学发展”为主题，组织开展第五届社会科学普及宣传周活动，被省社科联授予“组织活动奖”和“特色活动奖”。
2008年9月25日，市委宣传部、市文明办、市社科联组织省、市社科理论界的专家学者召开“‘大爱镇江’品牌建设研讨会”，就如何培养市民的“大爱精神”，推进“大爱镇江”品牌建设进行广泛研讨。市委常委、宣传部长张洪水出席并讲话，副市长王萍、老同志宋亚欣、市见义勇为基金会理事长卞大庆出席研讨会。
2008年11月14日，由南京、镇江、扬州三市社科联共同主办的“宁镇扬文化板块构建与共同发展论坛”在扬州大学虹桥专家楼召开，来自宁镇扬三市社科联系统及有关高校的领导和专家学者50多人参加论坛。
2009年
2009年，首次开展市社科应用研究课题立项，立项资助13项应用研究课题。3月邀请省社科规划办主任到镇江做专门辅导，市社科学会、市委党校、在镇高校30多人参加辅导会。全市有4项成果成为国家社科基金项目。
2009年，社科联组织省内知名专家组成课题组，专门研究“大爱镇江”现象，完成3万字研究报告。组织编写的通讯“大爱，镇江崛起的有一座金山”在8月12日《新华日报》要闻版刊发，《镇江社会科学》编印“大爱镇江”专刊，在“大爱之星”颁奖大会上发放。
2009年9月29日，由南京、镇江、扬州三市社科联及江苏大学共同主办的“第三届宁镇扬板块构建与区域共同发展”论坛在镇江碧榆
